Jak laboratoria kanalizacyjne mogą pomóc pokonać pandemię

Gdy patrzymy w kierunku długoterminowego zarządzania SARS-CoV- 2 (wirus wywołujący COVID-19), a także przewidywane pojawienie się innych nowych wirusów, rola badania ścieków nabiera nowego znaczenia. W rzeczywistości może się okazać, że w naszej ogólnej strategii odgrywa nawet większą rolę niż diagnostyka kliniczna.

Władze na całym świecie zaczęły dostrzegać jego znaczenie, a programy zaczęły już pojawiać się w hrabstwach i gminach Stany Zjednoczone i inne kraje. Według Agencji Ochrony Środowiska (EPA):

„Wstępne badania z całego kraju i świata wskazują, że monitorowanie ścieków pod kątem obecności markera genetycznego SARS-CoV- 2, jego RNA, może być przydatny jako wrażliwy wczesny wskaźnik niskiego poziomu zakażeń w społeczności. Posiadanie systemu wczesnego ostrzegania, ostrzegającego urzędników zdrowia publicznego o infekcji lub jej braku, może być pomocne w kierowaniu zasobów, takich jak indywidualne testy, do społeczności, które mogą ich najbardziej potrzebować ”.

Jak można zaangażować laboratoria

EPA prowadzi badania mające na celu opracowanie optymalnych programów i metod testowania SARS-CoV-2 w ściekach i opublikowała wytyczne w swojej witrynie dla laboratoriów chcących się zaangażować.

Centra Kontroli Chorób (CDC) również uznały ważną rolę badań ścieków i opublikowały wytyczne .

Połączenie dwóch obszarów wiedzy

Laboratoria oczyszczalni ścieków i laboratoria monitorowania środowiska mają pełną wiedzę na temat tego, czym jest zaangażowany w badanie ścieków: metody pobierania próbek, zbiorniki, głębokość, przepływ, rozcieńczenia, filtracja, próbki kontrolne i tym podobne. Z drugiej strony laboratoria, które są zaznajomione z testami COVID, prawdopodobnie nie mają najmniejszego pojęcia o takich rzeczach. Podobnie te laboratoria diagnostyki klinicznej rozumieją testy molekularne, w tym obsługę i przygotowanie próbek, ekstrakcję RNA, analizę rtPCR, wymagania HIPAA i CLIA itp.

Kliknij tutaj, aby poprosić o demo

Powiedz laboratorium klinicznemu, aby zebrało ścieki i przetestowało je pod kątem SARS-CoV-2, a beznadziejnie nie będą wyposażone. Ale sytuacja odwrotna nie jest tak prawdziwa. Laboratoria testujące ścieki znają wszystkie szczegóły, które mają wpływ na to, jak zbierać i przygotowywać próbki odpadów, aby umożliwić sensowną analizę. Wystarczy dodać oprzyrządowanie i protokoły PCR. I nie są one ograniczone przepisami HSS dotyczącymi testów na ludziach, które regulują laboratoria kliniczne. Jak dotąd nie ma dowodów na to, że materiały SARS-CoV-2 znalezione w odpadach stwarzają jakiekolwiek ryzyko infekcji.

Jak wygląda badanie ścieków COVID w praktyce?

Wynik jest to, że obserwujemy trzy główne sposoby przeprowadzania testów COVID w ściekach:

  1. Współpraca: Jednym z najbardziej naturalnych podejść jest laboratorium CLIA z partnerem w zakresie testów PCR oraz oczyszczalnia ścieków. Partnerstwo może różnić się podziałem obowiązków. W najpopularniejszej strukturze placówka WW zajmuje się pobieraniem i przygotowywaniem próbek, podczas gdy laboratorium kliniczne zajmuje się przygotowywaniem, ekstrakcją i testowaniem RNA. Raportowanie jest obecnie wysyłane do departamentów zdrowia publicznego, które mogą zająć się przekazywaniem danych do CDC. W przeciwnym razie wyniki kliniczne również należy przesłać do CDC. Niestety systemy różnią się w zależności od stanu, ale większość stanów pracuje nad skonsolidowaniem i uproszczeniem obciążeń związanych z raportowaniem w laboratoriach. Innym szeroko stosowanym podejściem jest placówki WW wysyłają próbki do programów badawczych , z których wiele jest finansowanych przez rząd za pośrednictwem uniwersytetów.
  2. Konsultacje: Laboratoria, które znajdują sami mogą to zrobić, oferując swoje usługi gminom, powiatom lub innym podmiotom posiadającym własne systemy kanalizacyjne.
  3. Wastewater Lab Testy COVID: Ten model rozwija się powoli i może okazać się najbardziej powszechny, ponieważ ogólna koncepcja epidemiologii opartej na ściekach staje się coraz bardziej akceptowana i uznawana jako normalna część gospodarki ściekowej. Rzeczywiście, najwyższe szczeble rządu USA kładą podwaliny pod uczynienie epidemiologii normalną częścią zarządzania ściekami.Centra Kontroli i Zapobiegania Chorobom (CDC) oraz Departament Zdrowia i Opieki Społecznej Stanów Zjednoczonych (HHS) we współpracy z agencjami rządu federalnego tworzą National Wastewater Surveillance System (NWSS) w odpowiedzi na pandemię COVID-19.

From CDC .gov :

CDC opracowuje obecnie portal dla stanowych, plemiennych, lokalnych i terytorialnych wydziałów zdrowia w celu przesyłania danych z badań ścieków do krajowej bazy danych w celu podsumowania oraz interpretowanie danych na potrzeby działań w zakresie zdrowia publicznego. Udział w krajowej bazie danych zapewni porównywalność danych w różnych jurysdykcjach. Dane z testów ścieków nie mają na celu zastąpienia istniejących systemów nadzoru COVID-19, ale mają na celu ich uzupełnienie poprzez dostarczenie:

– Wydajnej zbiorczej próbki społeczności.

– Dane dla społeczności, w których aktualne testy kliniczne COVID-19 są niedostatecznie wykorzystywane lub niedostępne.

– Dane na poziomie powiatów.

Kliknij tutaj, aby zamówić demo

Zarządzanie danymi

Zwróć uwagę, gdzie nacisk kładzie się na: dane. Pod koniec dnia to wszystko, o co chodzi w każdym laboratorium. Wszystko inne w rzeczywistości jest po prostu środkiem do zakończenia raportowania wyników. A jeśli chodzi o sytuację nadzwyczajną związaną z pandemią – lub monitorowanie jej i zapobieganie jej – jeszcze ważniejsze jest, aby dane były dokładne, kompletne i aktualne. I nie można temu zaprzeczyć, jedynym sposobem, aby się tego upewnić, jest automatyzacja, w szczególności LIMS (lub LIS, w żargonie medycznym). Eliminacja papierowego i ręcznego wprowadzania danych eliminuje błędy przy przepisywaniu, błędne odczytywanie pisma ręcznego, przeoczenia i błędne obliczenia. Pomaga też zapewnić terminowe raportowanie, które spełnia formaty i inne wymagania organów zdrowia publicznego i władz federalnych.

COVIDLiMS dla środowiska & Wastewater Labs

Wprowadzona w 2005 roku epidemiologia oparta na ściekach dopiero teraz zaczyna nabierać znaczenia klinicznego. Do niedawna jego stosowanie ograniczało się głównie do pomiaru nielegalnego spożycia narkotyków . W rezultacie LIMS / LIS zaprojektowane specjalnie do testowania COVID-19 są rzadkie. Zmiana przeznaczenia systemów na tę wyjątkową funkcjonalność może być trudna – lub przynajmniej czasochłonna – i kosztowna. Jedynym wyjątkiem jest COVIDLiMS for Environmental and Wastewater Laboratories z LabLynx, Inc. Laboratoria zajmujące się ochroną środowiska i ściekami od dawna używają podstawowego LIMS opartego na chmurze LabLynx, ELab. Niedawne wprowadzenie COVIDLiMS dla SARS-CoV- 2 zawiera wszystkie funkcje potrzebne zarówno do tradycyjnego testowania ścieków, jak i do testowania ścieków SARS-CoV-2.

Dołącz do walki

Jest taka możliwość. Poza nagrodami finansowymi laboratoria mają szansę wnieść znaczący wkład w walkę z COVID – a właściwie każdym podobnym zagrożeniem dla zdrowia – zarówno teraz, jak i na dłuższą metę, jako uznana część publicznych systemów opieki zdrowotnej. Dlaczego nie zaangażować się w tę nową, odważną branżę?

Jako lider w branży informatyki laboratoryjnej, LabLynx może pomóc Ci przejść przez proces wdrażania LIMS do testów COVID. Możemy dostosować nasze rozwiązanie COVIDLiMS do wyjątkowych potrzeb Twojego laboratorium w ciągu zaledwie tygodnia. Aby uzyskać więcej informacji, skontaktuj się z [email protected] lub zadzwoń pod numer 866-LABLYNX (522–5969) .

Kliknij tutaj, aby poprosić o demo

Referencje

Badania nad COVID-19 w środowisku | US EPA

Modelowanie aerozoli SARS-CoV-2 i ocena technik inaktywacji Wykrywanie i monitorowanie SARS-CoV-2 w ściekach…

www.epa.gov

Choroba koronawirusa 2019 (COVID-19)

Skorzystaj z tych wskazówek, aby wdrożyć monitorowanie chorób w oparciu o ścieki. Nadzór nad chorobami w ściekach to…

www.cdc.gov

Krajowy system nadzoru ścieków

Centra Kontroli i Zapobiegania Chorobom (CDC) oraz Departament Zdrowia i Opieki Społecznej Stanów Zjednoczonych (HHS), w…

www.cdc.gov

Miasto Burlington w stanie Vermont wykorzystuje innowacyjny program epidemiologiczny oparty na ściekach, aby zatrzymać…

NOWY JORK- – (BUSINESS WIRE) – Myślące przyszłościowo miasto Burlington w stanie Vermont wybrało firmę GoAigua opartą na ściekach…

www.wateronline.com

Okręg sanitarny hrabstwa Orange

COVID-19 drastycznie zmienił sytuację w krótkim czasie. Ponieważ był tak nieoczekiwany, przyniósł również ze sobą…

www.ocsd.com

Nowe śledzenie infekcji COVID-19 w ramach partnerstwa w Cambridge dzięki analizie ścieków

Nowe partnerstwo z Biobot Analytics, Inc. z Cambridge oferuje nowe podejście do śledzenia epidemii COVID-19…

www.cambridgema.gov

Wastewater-based epidemiology

Wastewater-based epidemiology (WBE) (lub monitoring oparty na ściekach lub wydobywanie chemikaliów w ściekach) to…

pl. wikipedia.lub g

COVIDLiMS dla środowiska & Wastewater Labs – COVIDLiMS.com

W pełni elastyczny system do zarządzania wszystkimi potrzebami w zakresie zarządzania danymi. Personel przesiewowy, kał, powietrze, woda lub…

www.covidlims.com

Dodaj komentarz

Twój adres email nie zostanie opublikowany. Pola, których wypełnienie jest wymagane, są oznaczone symbolem *