Hvordan avløpsvannlaboratorier kan bidra til å beseire pandemien

Når vi ser mot den langsiktige styringen av SARS-CoV- 2 (viruset som forårsaker COVID-19), og faktisk den forventede fremveksten av andre nye virus, får avløpsvannstesten en ny betydning. Faktisk kan det vise seg å spille en enda større rolle enn klinisk diagnostikk i vår overordnede strategi.

Myndigheter overalt har begynt å erkjenne dens betydning, og programmer har allerede begynt å vokse frem i fylker og kommuner i USA og andre land. Ifølge Environmental Protection Agency (EPA):

“Foreløpige undersøkelser fra hele landet og over hele verden indikerer at overvåking av avløpsvann for tilstedeværelsen av den genetiske markøren til SARS-CoV- 2, dets RNA, kan være nyttig som en sensitiv tidlig indikator for lave nivåer av infeksjoner i samfunnet. Å ha et system for tidlig varsling for å varsle folkehelsepersonell om infeksjon, eller mangel på infeksjon, kan være nyttig for å lede ressurser, for eksempel individuell testing, til samfunnene som kanskje trenger det mest. ”

/ blockquote>

Hvordan laboratorier kan involvere seg

EPA har forskning pågår for å utvikle optimale programmer og metoder for SARS-CoV-2-testing av avløpsvann og har publisert veiledning på nettstedet for laboratorier som ønsker å bli involvert.

The Centers for Disease Control (CDC) har anerkjent den viktige rollen som testing av avløpsvann også, og har publisert veiledning av seg selv.

Sammenslåing av to kompetanseområder

Laboratorier for renseanlegg og laboratorier for miljøovervåking har full forståelse av hva som er involvert i avløpsvannstesting: prøvetakingsmetoder, containere, dybde, strømning, fortynninger, filtrering, kontrollprøver og lignende. Labs som er kjent med COVID-testing, derimot, har sannsynligvis ikke den svakeste anelse om slike ting. På samme måte forstår disse kliniske diagnoselaboratoriene molekylær testing inkludert prøvehåndtering og prep, RNA-ekstraksjon, rtPCR-analyse, HIPAA og CLIA-krav osv.

Klikk her for å be om din demo

Be et klinisk laboratorium samle avløpsvann og teste for SARS-CoV-2, så ville de håpløst være utstyrt. Men det motsatte er ikke fullt så sant. Avløpsvannslaboratorier kjenner til alle detaljene som er av betydning for hvordan man samler inn og forbereder avfallsprøver for å gi meningsfull analyse. De trenger bare å legge til PCR-instrumentering og protokoller. Og de er ikke begrenset av HSS-forskriftene for humant pasienttesting som regulerer kliniske laboratorier. Til dags dato har det ikke vært bevis for at SARS-CoV-2-materiale som finnes i avfall, utgjør noen risiko for infeksjon.

Hvordan ser COVID-avløpsvannstesting ut i praksis?

Resultatet er at vi ser tre hovedmåter for COVID-testing av avløpsvann:

  1. Samarbeid: En av de mest naturlige tilnærmingene ser et CLIA-laboratorium med PCR-testfunksjoner samarbeider med et avløpsanlegg. Dette partnerskapet kan variere i ansvarsfordelingen. I den vanligste strukturen håndterer WW anlegget prøveinnsamling og prep mens det kliniske laboratoriet håndterer RNA prep, ekstraksjon og testing. Rapportering er for øyeblikket mandat til å bli sendt til folkehelseavdelingene, som kan ta seg av overføring av data til CDC. Ellers må de kliniske resultatene også sendes til CDC. Dessverre varierer systemene fra stat til stat – men de fleste stater jobber med å konsolidere og forenkle rapporteringsbyrder for laboratoriene. I en annen mye brukt tilnærming sender WW-anlegg prøver til forskningsprogrammer , hvorav mange er statlig finansiert gjennom universiteter.
  2. Rådgivning: Labs som finner selv i posisjon til å tilby tjenestene til kommuner, fylker eller andre enheter med egne kloakkanlegg.
  3. Avløpsvannlaboratorium COVID Testing: Denne modellen vokser sakte og kan vise seg å være den vanligste, ettersom det generelle begrepet avløpsbasert epidemiologi blir mer akseptert og etablert som en normal del av avløpsvannhåndteringen. De høyeste nivåene i den amerikanske regjeringen legger faktisk grunnlaget for å gjøre epidemiologi til en normal del av avløpsvannforvaltningen.Centers for Disease Control and Prevention (CDC) og US Department of Health and Human Services (HHS), i samarbeid med byråer i hele den føderale regjeringen, lager National Wastewater Surveillance System (NWSS) som svar på COVID-19-pandemien.

Fra CDC .gov :

CDC utvikler for tiden en portal for statlige, stamme-, lokale og territoriale helseavdelinger for å sende data om avløpsvannstesting i en nasjonal database for bruk i oppsummering og tolke data for folkehelseaksjon. Deltakelse i en nasjonal database vil sikre data sammenlignbarhet på tvers av jurisdiksjoner. Data fra avløpsvannstesting er ikke ment å erstatte eksisterende COVID-19-overvåkningssystemer, men er ment å utfylle dem ved å tilby:

– Et effektivt samlet samfunnsutvalg.

– Data for lokalsamfunn der rettidig COVID-19 klinisk testing er underutnyttet eller utilgjengelig.

– Data på fylkesnivå.

Klikk her for å be om din demo

Databehandling

Legg merke til hvor vekt er: data. På slutten av dagen er det alt laboratoriet handler om. Alt annet er i virkeligheten bare et middel til slutten av rapportering av resultater. Og når det gjelder en pandemisituasjon – eller overvåking og forebygging av dem – er det enda viktigere at dataene er nøyaktige, komplette og rettidige. Og det kan ikke benektes, den eneste måten å være sikker på er via automatisering, spesielt en LIMS (eller LIS, på medisinsk språk). Å eliminere papir og manuell dataregistrering eliminerer transkripsjonsfeil, feillesing av håndskrift, mangler og feilberegninger. Og det hjelper med å sikre rettidig rapportering som oppfyller formater og andre krav fra folkehelse og føderale myndigheter.

COVIDLiMS for Environmental & Wastewater Labs

Avløpsbasert epidemiologi, introdusert i 2005, begynner nå å vokse til klinisk betydning. Inntil nylig var bruken i stor grad begrenset til måling av ulovlig narkotikaforbruk . Derfor er LIMS / LIS designet spesielt for COVID-19-testing knappe. Ominnstilling av systemer for denne unike funksjonaliteten kan være vanskelig – eller i det minste tidkrevende – og dyrt. Ett unntak er COVIDLiMS for miljø- og avløpslaboratorier fra LabLynx, Inc. Miljø- og avløpslaboratorier har lenge brukt LabLynxs grunnleggende skybaserte LIMS, ELab. Den nylige introduksjonen av COVIDLiMS for SARS-CoV- 2-testing inneholder all funksjonaliteten som trengs for både tradisjonell avløpsvannstesting og SARS-CoV-2-testing av avløpsvann.

Bli med i kampen

Muligheten er der. Og utover de økonomiske fordelene, har laboratorier sjansen til å gi et meningsfullt bidrag til kampen mot COVID – faktisk en lignende helsetrussel – både nå og på lang sikt, som en etablert del av offentlige helsesystemer. Hvorfor ikke bli involvert i denne modige nye bransjen?

Som bransjeleder innen laboratorieinformatikk, kan LabLynx hjelpe deg gjennom LIMS for distribusjonsprosessen for COVID-testing. Vi kan skreddersy COVIDLiMS-løsningen til laboratoriets unike behov på så lite som en uke. For mer informasjon, kontakt på [email protected] eller ring 866-LABLYNX (522–5969) .

Klikk her for å be om din demo

Referanser

Forskning på COVID-19 i miljøet | US EPA

Modellering av SARS-CoV-2 aerosoler og evaluering av inaktiveringsteknikker Deteksjon og overvåking av SARS-CoV-2 i avløpsvann…

www.epa.gov

Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)

Bruk denne veiledningen til å implementere avløpsbasert sykdomsovervåking. Avløpsbasert sykdomsovervåking er en…

www.cdc.gov

National Wastewater Surveillance System

Centers for Disease Control and Prevention (CDC) og US Department of Health and Human Services (HHS), i…

www.cdc.gov

Byen Burlington, Vermont utnytter innovativt avløpsbasert epidemiologisk program for å stoppe…

NEW YORK- – (BUSINESS WIRE) – Den fremtidsrettede byen Burlington, Vermont har valgt GoAigua «Wastewater-based…

www.wateronline.com

Orange County Sanitation District

COVID-19 endret ting drastisk på kort tid. Fordi det var så uventet, førte det også med seg …

www.ocsd.com

Nye partnerskapsspor COVID-19-infeksjoner i Cambridge ved å analysere avløpsvann

Et nytt partnerskap med Biobot Analytics, Inc. i Cambridge tilbyr en ny tilnærming til å spore COVID-19-utbrudd …

www.cambridgema.gov

Avløpsbasert epidemiologi

Avløpsbasert epidemiologi (WBE) (eller avløpsbasert overvåking eller kjemisk informasjonsutvinning) er en…

no. wikipedia.or g

COVIDLiMS for Environmental & Wastewater Labs – COVIDLiMS.com

Det komplette fleksible systemet for å administrere alle dine behov for datastyring. Skjermpersonale, prosessfekal, luft, vann eller …

www.covidlims.com

Legg igjen en kommentar

Din e-postadresse vil ikke bli publisert. Obligatoriske felt er merket med *