Come Wastewater Labs può aiutare a sconfiggere la pandemia

Considerando la gestione a lungo termine di SARS-CoV- 2 (il virus che causa COVID-19), e in effetti lemergere anticipato di altri nuovi virus, il ruolo dei test sulle acque reflue sta assumendo un nuovo significato. In effetti, potrebbe rivelarsi avere un ruolo ancora maggiore della diagnostica clinica nella nostra strategia complessiva.

Le autorità di tutto il mondo hanno iniziato a riconoscerne limportanza e i programmi hanno già iniziato a nascere nelle contee e nei comuni del Stati Uniti e altri paesi. Secondo lEnvironmental Protection Agency (EPA):

“Ricerche preliminari in tutto il paese e in tutto il mondo indicano che il monitoraggio delle acque reflue per la presenza del marker genetico di SARS-CoV- 2, il suo RNA, può essere utile come indicatore precoce sensibile di bassi livelli di infezioni nella comunità. Avere un sistema di allerta precoce per allertare i funzionari della sanità pubblica sullinfezione o sulla mancanza di infezione potrebbe essere utile per indirizzare le risorse, come i test individuali, alle comunità che potrebbero averne più bisogno. “

In che modo i laboratori possono essere coinvolti

LEPA ha in corso ricerche per sviluppare programmi e metodi ottimali per i test SARS-CoV-2 sulle acque reflue e ha pubblicato guida sul suo sito per i laboratori che desiderano essere coinvolti.

Anche i Centers for Disease Control (CDC) hanno riconosciuto limportante ruolo dei test sulle acque reflue e hanno pubblicato guida a sé stante.

Unione di due aree di competenza

I laboratori degli impianti di trattamento delle acque reflue e i laboratori di monitoraggio ambientale hanno una comprensione completa di ciò che è coinvolti nelle analisi delle acque reflue: metodi di campionamento, contenitori, profondità, flusso, diluizioni, filtrazione, campioni di controllo e simili. I laboratori che hanno familiarità con i test COVID, daltra parte, probabilmente non hanno la più pallida idea di queste cose. Allo stesso modo, questi laboratori di diagnostica clinica comprendono i test molecolari tra cui la manipolazione e la preparazione dei campioni, lestrazione dellRNA, lanalisi rtPCR, i requisiti HIPAA e CLIA, ecc.

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Dì a un laboratorio clinico di raccogliere le acque reflue e testare la SARS-CoV-2 e sarebbero irrimediabilmente non attrezzati. Ma il contrario non è altrettanto vero. I laboratori di analisi delle acque reflue conoscono tutti i dettagli che influiscono su come raccogliere e preparare campioni di rifiuti per eseguire analisi significative. Hanno solo bisogno di aggiungere strumentazione e protocolli PCR. E non sono vincolati dalle normative HSS sui test sui pazienti umani che regolano i laboratori clinici. Ad oggi, non ci sono prove che i materiali SARS-CoV-2 trovati nei rifiuti presentino rischi di infezione.

Che aspetto hanno i test COVID sulle acque reflue nella pratica?

Il risultato è che stiamo vedendo tre modi principali in cui vengono eseguiti i test COVID per le acque reflue:

  1. Collaborazione: Uno degli approcci più naturali vede un laboratorio CLIA con capacità di test PCR collaborare con una struttura per le acque reflue. Questa partnership può variare nella divisione delle responsabilità. Nella struttura più comune, la struttura WW gestisce la raccolta e la preparazione dei campioni mentre il laboratorio clinico gestisce la preparazione, lestrazione e il test dellRNA. La segnalazione è attualmente incaricata di essere inviata ai dipartimenti di sanità pubblica, che possono occuparsi del passaggio dei dati al CDC. In caso contrario, anche i risultati clinici devono essere inviati al CDC. Sfortunatamente, i sistemi variano da stato a stato, ma la maggior parte degli stati sta lavorando per consolidare e semplificare gli oneri di segnalazione per i laboratori. In un altro approccio ampiamente utilizzato, le strutture WW inviano campioni ai programmi di ricerca , molti dei quali sono finanziati dal governo attraverso le università.
  2. Consulenza: Labs che trovano essi stessi in grado di farlo stanno offrendo i propri servizi a comuni, contee o altri enti con i propri sistemi fognari.
  3. Wastewater Lab COVID Testing: Questo modello sta crescendo lentamente e potrebbe rivelarsi il più comune, poiché il concetto generale di epidemiologia basata sulle acque reflue diventa più accettato e stabilito come parte normale della gestione delle acque reflue. In effetti, i livelli più alti nel governo degli Stati Uniti stanno gettando le basi per rendere lepidemiologia una parte normale della gestione delle acque reflue.I Centers for Disease Control and Prevention (CDC) e il Department of Health and Human Services (HHS) degli Stati Uniti, in collaborazione con le agenzie di tutto il governo federale, stanno creando il National Wastewater Surveillance Sistema (NWSS) in risposta alla pandemia COVID-19.

Da CDC .gov :

CDC sta attualmente sviluppando un portale per i dipartimenti sanitari statali, tribali, locali e territoriali per inviare i dati dei test sulle acque reflue in un database nazionale da utilizzare in sintesi e interpretare i dati per lazione di sanità pubblica. La partecipazione a un database nazionale garantirà la comparabilità dei dati tra le giurisdizioni. I dati dei test sulle acque reflue non intendono sostituire i sistemi di sorveglianza COVID-19 esistenti, ma integrarli fornendo:

– Un campione comunitario efficiente.

– Dati per comunità in cui i test clinici COVID-19 tempestivi sono sottoutilizzati o non disponibili.

– Dati a livello di sotto-contea.

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Gestione dati

Nota dove lenfasi è: dati. Alla fine della giornata, questo è tutto ciò di cui si occupa un laboratorio. Tutto il resto è, in realtà, semplicemente un mezzo per la fine della rendicontazione dei risultati. E quando si tratta di unemergenza pandemica – o del suo monitoraggio e prevenzione – è ancora più imperativo che i dati siano accurati, completi e tempestivi. E non si può negarlo, lunico modo per esserne sicuri è attraverso lautomazione, in particolare un LIMS (o LIS, in gergo medico). Eliminando la carta e limmissione manuale dei dati si eliminano errori di trascrizione, errori di lettura della grafia, omissioni e calcoli errati. Inoltre, aiuta a garantire rapporti tempestivi che soddisfano i formati e altri requisiti della sanità pubblica e delle autorità federali.

COVIDLiMS for Environmental & Wastewater Labs

Lepidemiologia basata sulle acque reflue, introdotta nel 2005, comincia solo ora a diventare un significato clinico. Fino a poco tempo, il suo utilizzo era in gran parte limitato alla misurazione del consumo di droghe illecite . Di conseguenza, LIMS / LIS progettati specificamente per i test COVID-19 sono scarsi. Riproporre i sistemi per questa funzionalità unica può essere difficile, o almeno richiedere molto tempo e costoso. Uneccezione è COVIDLiMS for Environmental and Wastewater Laboratories da LabLynx, Inc. I laboratori ambientali e delle acque reflue utilizzano da tempo il LIMS di base basato su cloud di LabLynx, ELab. La recente introduzione di COVIDLiMS per SARS-CoV- 2 incorpora tutte le funzionalità necessarie sia per i test tradizionali sulle acque reflue che per i test SARS-CoV-2 sulle acque reflue.

Unisciti alla lotta

Lopportunità è lì. E al di là delle ricompense finanziarie, i laboratori hanno la possibilità di dare un contributo significativo alla battaglia contro COVID – anzi ogni simile minaccia per la salute – sia ora che a lungo termine, come parte consolidata dei sistemi sanitari pubblici. Perché non farti coinvolgere in questo nuovo e coraggioso settore?

In qualità di leader del settore nellinformatica di laboratorio, LabLynx può aiutarti attraverso il processo di implementazione dei test LIMS per COVID. Possiamo adattare la nostra soluzione COVIDLiMS alle esigenze specifiche del tuo laboratorio in appena una settimana. Per ulteriori informazioni, contatta [email protected] o chiama 866-LABLYNX (522–5969) .

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Riferimenti

Ricerca su COVID-19 nellambiente | US EPA

Modellazione degli aerosol SARS-CoV-2 e valutazione delle tecniche di inattivazione Rilevamento e monitoraggio di SARS-CoV-2 nelle acque reflue …

www.epa.gov

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