Comment Wastewater Labs peut aider à vaincre la pandémie

Alors que nous envisageons la gestion à long terme du SARS-CoV- 2 (le virus qui cause le COVID-19), et en fait lémergence prévue dautres virus nouveaux, le rôle des analyses des eaux usées prend une nouvelle importance. En fait, il pourrait savérer jouer un rôle encore plus important que le diagnostic clinique dans notre stratégie globale.

Partout, les autorités ont commencé à reconnaître son importance et des programmes ont déjà commencé à voir le jour dans les comtés et les municipalités du États-Unis et autres pays. Selon lAgence de protection de lenvironnement (EPA):

«Des recherches préliminaires à travers le pays et dans le monde indiquent que la surveillance des eaux usées pour la présence du marqueur génétique du SRAS-CoV- 2, son ARN, peut être utile comme indicateur précoce sensible des faibles niveaux dinfection dans la communauté. Disposer dun système dalerte précoce pour alerter les responsables de la santé publique de linfection ou de labsence dinfection pourrait être utile pour diriger des ressources, telles que des tests individuels, vers les communautés qui pourraient en avoir le plus besoin. »

Comment les laboratoires peuvent simpliquer

LEPA a des recherches en cours pour développer des programmes et des méthodes optimaux pour les tests SARS-CoV-2 des eaux usées et a publié guidance sur son site pour les laboratoires souhaitant simpliquer.

Le Les Centers for Disease Control (CDC) ont également reconnu le rôle important des analyses des eaux usées et ont publié des conseils de son propre chef.

Fusion de deux domaines dexpertise

Les laboratoires des usines de traitement des eaux usées et les laboratoires de surveillance de lenvironnement ont une compréhension complète de ce qui est impliqués dans lanalyse des eaux usées: méthodes déchantillonnage, conteneurs, profondeur, débit, dilutions, filtration, échantillons témoins et analogues. Les laboratoires familiers avec les tests COVID, en revanche, nont probablement pas le moindre indice sur de telles choses. De même, ces laboratoires de diagnostic clinique comprennent les tests moléculaires, y compris la manipulation et la préparation des échantillons, lextraction dARN, lanalyse rtPCR, les exigences HIPAA et CLIA, etc.

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Dites à un laboratoire clinique de collecter les eaux usées et de tester le SRAS-CoV-2 et ils seraient désespérément mal équipés. Mais l’inverse n’est pas aussi vrai. Les laboratoires danalyse des eaux usées connaissent tous les détails qui déterminent la manière de collecter et de préparer les échantillons de déchets pour rendre une analyse significative. Ils nont quà ajouter des instruments et des protocoles de PCR. Et ils ne sont pas limités par les règlements sur les tests sur les patients humains HSS qui régissent les laboratoires cliniques. À ce jour, il ny a eu aucune preuve que les matériaux SARS-CoV-2 trouvés dans les déchets présentent un risque dinfection.

À quoi ressemblent les tests COVID des eaux usées en pratique?

Le résultat est que nous voyons trois façons principales de tester le COVID des eaux usées:

  1. Collaboration: Lune des approches les plus naturelles consiste à ce quun laboratoire CLIA doté de capacités de test PCR sassocie à une installation de traitement des eaux usées. Ce partenariat peut varier dans la répartition des responsabilités. Dans la structure la plus courante, linstallation WW gère la collecte et la préparation des échantillons tandis que le laboratoire clinique gère la préparation, lextraction et les tests de lARN. Les rapports doivent actuellement être envoyés aux services de santé publique, qui peuvent se charger de transmettre les données au CDC. Sinon, les résultats cliniques doivent également être envoyés au CDC. Malheureusement, les systèmes varient dun État à lautre, mais la plupart des États sefforcent de consolider et de simplifier les charges de reporting pour les laboratoires. Dans une autre approche largement utilisée, les installations WW envoient des échantillons aux programmes de recherche , dont beaucoup sont financés par le gouvernement par le biais des universités.
  2. Consultation: Labs qui trouvent eux-mêmes en mesure de le faire offrent leurs services aux municipalités, comtés ou autres entités disposant de leurs propres systèmes dégouts.
  3. Test COVID du Wastewater Lab: Ce modèle se développe lentement et peut savérer être le plus courant, car le concept général dépidémiologie basée sur les eaux usées devient de plus en plus accepté et établi en tant quélément normal de la gestion des eaux usées. En effet, les plus hauts niveaux du gouvernement américain jettent les bases pour faire de lépidémiologie une partie normale de la gestion des eaux usées.Les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) et le Department of Health and Human Services (HHS) des États-Unis, en collaboration avec des organismes du gouvernement fédéral, créent le National Wastewater Surveillance Système (NWSS) en réponse à la pandémie COVID-19.

De CDC .gov :

Le CDC développe actuellement un portail permettant aux services de santé des États, des tribus, des collectivités locales et territoriales de soumettre les données danalyse des eaux usées dans une base de données nationale pour les et interpréter les données pour laction de santé publique. La participation à une base de données nationale garantira la comparabilité des données entre les juridictions. Les données provenant des analyses des eaux usées ne sont pas destinées à remplacer les systèmes de surveillance COVID-19 existants, mais sont destinées à les compléter en fournissant:

– Un échantillon communautaire efficace.

– Données pour les communautés où les tests cliniques COVID-19 en temps opportun sont sous-utilisés ou indisponibles.

– Données au niveau du sous-comté.

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Gestion des données

Notez où laccent est mis: données. À la fin de la journée, cest tout ce dont tout laboratoire est question. Tout le reste est, en réalité, simplement un moyen de rendre compte des résultats. Et lorsquil sagit dune urgence pandémique – ou de sa surveillance et de sa prévention – il est encore plus impératif que les données soient exactes, complètes et opportunes. Et on ne peut le nier, le seul moyen d’en être sûr est l’automatisation, en particulier un LIMS (ou LIS, dans le langage médical). Lélimination de la saisie manuelle et papier des données élimine les erreurs de transcription, la mauvaise lecture de lécriture manuscrite, les omissions et les calculs erronés. Et cela permet de garantir des rapports en temps opportun qui répondent aux formats et autres exigences de la santé publique et des autorités fédérales.

COVIDLiMS for Environmental & Wastewater Labs

Lépidémiologie basée sur les eaux usées, introduite en 2005, commence seulement à prendre une importance clinique. Jusquà récemment, son utilisation était largement limitée à mesurer la consommation de drogues illicites . Par conséquent, les LIMS / LIS conçus spécifiquement pour les tests COVID-19 sont rares. La réorientation des systèmes pour cette fonctionnalité unique peut être difficile – ou du moins longue – et coûteuse. Une exception est COVIDLiMS for Environmental and Wastewater Laboratories de LabLynx, Inc. Les laboratoires environnementaux et de traitement des eaux usées utilisent depuis longtemps le LIMS, ELab, basé sur le cloud de LabLynx. Lintroduction récente de COVIDLiMS pour le SARS-CoV- Les tests 2 intègrent toutes les fonctionnalités nécessaires à la fois pour les tests traditionnels des eaux usées et pour les tests SARS-CoV-2 des eaux usées.

Rejoignez le combat

Lopportunité est là. Et au-delà des récompenses financières, les laboratoires ont la possibilité dapporter une contribution significative à la lutte contre le COVID – en fait toute menace similaire pour la santé – à la fois maintenant et à long terme, en tant que partie établie des systèmes de santé publique. Pourquoi ne pas vous impliquer dans cette nouvelle industrie courageuse?

En tant que leader du secteur de linformatique de laboratoire, LabLynx peut vous aider tout au long du processus de déploiement des tests LIMS for COVID. Nous pouvons adapter notre solution COVIDLiMS aux besoins uniques de votre laboratoire en aussi peu quune semaine. Pour plus dinformations, contactez à [email protected] ou appelez le 866-LABLYNX (522-5969) .

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Références

Recherche sur le COVID-19 dans lenvironnement | US EPA

Modélisation des aérosols du SRAS-CoV-2 et évaluation des techniques d’inactivation Détection et surveillance du SRAS-CoV-2 dans les eaux usées…

www.epa.gov

Maladie à coronavirus 2019 (COVID-19)

Utilisez ces conseils pour mettre en œuvre la surveillance des maladies basées sur les eaux usées. La surveillance des maladies liées aux eaux usées est un…

www.cdc.gov

Système national de surveillance des eaux usées

Les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) et le Département américain de la santé et des services sociaux (HHS), à…

www.cdc.gov

La ville de Burlington, dans le Vermont, utilise un programme dépidémiologie innovant basé sur les eaux usées pour arrêter…

NEW YORK – (BUSINESS WIRE) – La ville avant-gardiste de Burlington, dans le Vermont, a choisi GoAigua « s Wastewater-based…

www.wateronline.com

Orange County Sanitation District

COVID-19 a radicalement changé les choses en peu de temps. Parce quil était tellement inattendu, il a également amené avec lui…

www.ocsd.com

Un nouveau partenariat suit les infections au COVID-19 à Cambridge en analysant les eaux usées

Un nouveau partenariat avec Biobot Analytics, Inc. à Cambridge offre une nouvelle approche pour suivre les épidémies de COVID-19…

www.cambridgema.gov

Épidémiologie basée sur les eaux usées

Lépidémiologie basée sur les eaux usées (WBE) (ou surveillance basée sur les eaux usées ou extraction dinformations chimiques sur les eaux usées) est un…

fr. wikipedia.or g

COVIDLiMS pour lenvironnement & Wastewater Labs – COVIDLiMS.com

Le système flexible complet pour gérer tous vos besoins de gestion de données. Filtrer le personnel, traiter les matières fécales, lair, leau ou…

www.covidlims.com

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