Cómo los laboratorios de aguas residuales pueden ayudar a derrotar la pandemia

Mientras miramos hacia el manejo a largo plazo del SARS-CoV- 2 (el virus que causa COVID-19) y, de hecho, la aparición anticipada de otros virus nuevos, el papel de las pruebas de aguas residuales está adquiriendo un nuevo significado. De hecho, puede llegar a desempeñar un papel aún mayor que el diagnóstico clínico en nuestra estrategia general.

Las autoridades de todo el mundo han comenzado a reconocer su importancia, y ya han comenzado a surgir programas en los condados y municipios de Estados Unidos y otros países. Según la Agencia de Protección Ambiental (EPA):

“Investigaciones preliminares de todo el país y de todo el mundo indican que monitorear las aguas residuales para detectar la presencia del marcador genético de SARS-CoV- 2, su ARN, puede ser útil como un indicador temprano sensible de bajos niveles de infecciones en la comunidad. Tener un sistema de alerta temprana para alertar a los funcionarios de salud pública sobre la infección, o la falta de infección, podría ser útil para dirigir recursos, como las pruebas individuales, a las comunidades que más lo necesiten ”.

Cómo pueden participar los laboratorios

La EPA tiene una investigación en progreso para desarrollar programas y métodos óptimos para las pruebas de SARS-CoV-2 en aguas residuales y ha publicado orientación en su sitio para laboratorios que deseen participar.

El Los Centros para el Control de Enfermedades (CDC) también han reconocido la importante función de las pruebas de aguas residuales y han publicado directrices propio.

Fusionando dos áreas de especialización

Los laboratorios de plantas de tratamiento de aguas residuales y los laboratorios de monitoreo ambiental tienen una comprensión completa de lo que es involucrados en las pruebas de aguas residuales: métodos de muestreo, contenedores, profundidad, flujo, diluciones, filtración, muestras de control y similares. Los laboratorios que están familiarizados con las pruebas COVID, por otro lado, probablemente no tengan la menor idea sobre tales cosas. Del mismo modo, esos laboratorios de diagnóstico clínico comprenden las pruebas moleculares, incluido el manejo y preparación de muestras, extracción de ARN, análisis rtPCR, requisitos de HIPAA y CLIA, etc.

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Dígale a un laboratorio clínico que recolecte aguas residuales y realice pruebas para el SARS-CoV-2 y no tendrán remedio. Pero lo contrario no es tan cierto. Los laboratorios de análisis de aguas residuales conocen todos los detalles que influyen en cómo recolectar y preparar muestras de desechos para hacer un análisis significativo. Solo necesitan agregar instrumentación y protocolos de PCR. Y no están limitados por las regulaciones de pruebas de pacientes humanos de HSS que rigen los laboratorios clínicos. Hasta la fecha, no ha habido evidencia de que los materiales del SARS-CoV-2 encontrados en los desechos presenten algún riesgo de infección.

¿Cómo se ven en la práctica las pruebas de aguas residuales de COVID?

El resultado es que estamos viendo tres formas principales en que se realizan las pruebas de COVID de aguas residuales:

  1. Colaboración: Uno de los enfoques más naturales es que un laboratorio CLIA con capacidades de prueba de PCR se asocie con una instalación de aguas residuales. Esta asociación puede variar en la división de responsabilidades. En la estructura más común, la instalación de WW maneja la recolección y preparación de muestras, mientras que el laboratorio clínico maneja la preparación, extracción y análisis de ARN. Actualmente, se exige que los informes se envíen a los departamentos de salud pública, quienes pueden encargarse de pasar los datos a los CDC. De lo contrario, los resultados clínicos también deben enviarse a los CDC. Desafortunadamente, los sistemas varían de un estado a otro, pero la mayoría de los estados están trabajando para consolidar y simplificar la carga de informes para los laboratorios. En otro enfoque ampliamente utilizado, Las instalaciones de WW envían muestras a programas de investigación , muchas de las cuales son financiadas por el gobierno a través de universidades.
  2. Consultoría: Labs que encuentran ellos mismos en condiciones de hacerlo están ofreciendo sus servicios a municipios, condados u otras entidades con sus propios sistemas de alcantarillado.
  3. Laboratorio de aguas residuales Pruebas COVID: Este modelo está creciendo lentamente y puede llegar a ser el más común, ya que el concepto general de epidemiología basada en aguas residuales se vuelve más aceptado y establecido como una parte normal de la gestión de aguas residuales. De hecho, los niveles más altos del gobierno de los Estados Unidos están sentando las bases para hacer de la epidemiología una parte normal de la gestión de las aguas residuales.Los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) y el Departamento de Salud y Servicios Humanos (HHS) de EE. UU., En colaboración con agencias de todo el gobierno federal, están creando la Vigilancia Nacional de Aguas Residuales Sistema (NWSS) en respuesta a la pandemia de COVID-19.

De CDC .gov :

Los CDC están desarrollando actualmente un portal para que los departamentos de salud estatales, tribales, locales y territoriales envíen datos de pruebas de aguas residuales a una base de datos nacional para su uso en resúmenes e interpretación de datos para acciones de salud pública. La participación en una base de datos nacional garantizará la comparabilidad de los datos entre jurisdicciones. Los datos de las pruebas de aguas residuales no están destinados a reemplazar los sistemas de vigilancia COVID-19 existentes, sino que están destinados a complementarlos al proporcionar:

– Una muestra comunitaria conjunta eficiente.

– Datos para comunidades donde las pruebas clínicas oportunas de COVID-19 no se utilizan o no están disponibles.

– Datos a nivel de subcondados.

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Administración de datos

Observe dónde está el énfasis: datos. Al final del día, de eso se trata todo laboratorio. Todo lo demás es, en realidad, simplemente un medio para el fin de informar los resultados. Y cuando se trata de una emergencia pandémica, o de su monitoreo y prevención, es aún más imperativo que los datos sean precisos, completos y oportunos. Y no se puede negar, la única forma de estar seguro es a través de la automatización, específicamente un LIMS (o LIS, en el lenguaje médico). La eliminación de la entrada de datos en papel y manual elimina los errores de transcripción, la mala lectura de la escritura, las omisiones y los cálculos defectuosos. Y ayuda a garantizar informes oportunos que cumplan con los formatos y otros requisitos de las autoridades federales y de salud pública.

COVIDLiMS for Environmental & Wastewater Labs

La epidemiología basada en las aguas residuales, introducida en 2005, recién ahora está comenzando a adquirir importancia clínica. Hasta hace poco, su uso se limitaba en gran medida a medir el consumo de drogas ilícitas . En consecuencia, los LIMS / LIS diseñados específicamente para las pruebas de COVID-19 son escasos. Reorientar los sistemas para esta funcionalidad única puede ser difícil, o al menos llevar mucho tiempo y ser costoso. Una excepción es COVIDLiMS for Environmental and Wastewater Laboratories de LabLynx, Inc. Los laboratorios ambientales y de aguas residuales han utilizado durante mucho tiempo el LIMS fundamental basado en la nube de LabLynx, ELab. La reciente introducción de COVIDLiMS para el SARS-CoV- 2 incorpora toda la funcionalidad necesaria para las pruebas tradicionales de aguas residuales y las pruebas de SARS-CoV-2 de aguas residuales.

Únase a la lucha

La oportunidad está ahí. Y más allá de las recompensas financieras, los laboratorios tienen la oportunidad de hacer una contribución significativa a la batalla contra COVID – de hecho, cualquier amenaza para la salud similar – tanto ahora como a largo plazo, como una parte establecida de los sistemas de salud pública. ¿Por qué no participar en esta nueva y valiente industria?

Como líder de la industria en informática de laboratorio, LabLynx puede ayudarlo a través del proceso de implementación de pruebas de LIMS para COVID. Podemos adaptar nuestra solución COVIDLiMS a las necesidades únicas de su laboratorio en tan solo una semana. Para obtener más información, comuníquese con [email protected] o llame a 866-LABLYNX (522–5969) .

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Referencias

Investigación sobre COVID-19 en el Medio Ambiente | US EPA

Modelado de aerosoles SARS-CoV-2 y evaluación de técnicas de inactivación Detección y monitoreo del SARS-CoV-2 en aguas residuales…

www.epa.gov

Enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19)

Utilice esta guía para implementar la vigilancia de enfermedades basada en aguas residuales. La vigilancia de enfermedades de las aguas residuales es un…

www.cdc.gov

Sistema Nacional de Vigilancia de Aguas Residuales

Los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) y el Departamento de Salud y Servicios Humanos (HHS) de EE. UU., en…

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Epidemiología basada en aguas residuales

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en. wikipedia. o g

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