Hvordan spildevandslaboratorier kan hjælpe med at besejre pandemien

Når vi ser på den langsigtede styring af SARS-CoV- 2 (den virus, der forårsager COVID-19) og faktisk den forventede fremkomst af andre nye vira, får spildevandstestens rolle ny betydning. Faktisk kan det vise sig at spille en endnu større rolle end klinisk diagnostik i vores overordnede strategi.

Myndigheder overalt er begyndt at erkende dets betydning, og programmer er allerede begyndt at springe op i amter og kommuner i USA og andre lande. Ifølge Environmental Protection Agency (EPA):

“Foreløbig forskning fra hele landet og rundt om i verden indikerer, at overvågning af spildevand for tilstedeværelsen af ​​den genetiske markør for SARS-CoV- 2, dets RNA, kan være nyttigt som en følsom tidlig indikator for lave infektionsniveauer i samfundet. At have et tidligt varslingssystem til at advare folkesundhedsembedsmænd om infektion eller mangel på infektion kan være nyttigt at dirigere ressourcer, såsom individuel testning, til de samfund, der måske har mest brug for det. ”

Hvordan laboratorier kan blive involveret

EPA har forskning i gang med at udvikle optimale programmer og metoder til spildevand SARS-CoV-2 test og har offentliggjort vejledning på sit websted til laboratorier, der ønsker at blive involveret.

Centers for Disease Control (CDC) har også anerkendt den vigtige rolle som spildevandstestning og har offentliggjort vejledning .

Fletning af to ekspertiseområder

Laboratorier for spildevandsrensning og laboratorier for miljøovervågning har en fuldstændig forståelse af, hvad der er involveret i spildevandstestning: prøveudtagningsmetoder, containere, dybde, flow, fortyndinger, filtrering, kontrolprøver og lignende. Labs, der er fortrolige med COVID-test, har på den anden side sandsynligvis ikke den svageste anelse om sådanne ting. Ligeledes forstår disse kliniske diagnostiklaboratorier molekylær test inklusive prøvehåndtering og præparat, RNA-ekstraktion, rtPCR-analyse, HIPAA- og CLIA-krav osv.

Klik her for at anmode om din demo

Bed et klinisk laboratorium om at opsamle spildevand og teste for SARS-CoV-2, så er de håbløst udstyrede. Men det modsatte er ikke helt så sandt. Spildevandstestlaboratorier kender alle de detaljer, der indgår i, hvordan man indsamler og forbereder affaldsprøver til at gøre meningsfuld analyse. De behøver kun tilføje PCR-instrumentering og protokoller. Og de er ikke begrænset af HSS-forskrifterne for testning af humane patienter, der regulerer kliniske laboratorier. Til dato har der ikke været noget bevis for, at SARS-CoV-2-materialer, der findes i affald, udgør nogen risiko for infektion.

Hvordan ser COVID-spildevandstest ud i praksis?

Resultatet er, at vi ser tre vigtigste måder, hvorpå COVID-testning af spildevand udføres:

  1. Samarbejde: En af de mest naturlige tilgange ser et CLIA-laboratorium med PCR-testfunktioner er partner med et spildevandsanlæg. Dette partnerskab kan variere i ansvarsfordelingen. I den mest almindelige struktur håndterer WW-anlægget prøveindsamling og præparat, mens det kliniske laboratorium håndterer RNA-præparation, ekstraktion og test. Rapportering er i øjeblikket mandat til at blive sendt til folkesundhedsafdelinger, der muligvis tager sig af at videregive data til CDC. Ellers skal de kliniske resultater også sendes til CDC. Desværre varierer systemer fra stat til stat – men de fleste stater arbejder på at konsolidere og forenkle rapporteringsbyrder for laboratorierne. I en anden udbredt tilgang sender WW-faciliteter prøver til forskningsprogrammer , hvoraf mange er statsfinansieret gennem universiteter.
  2. Rådgivning: Labs, der finder selv i stand til at tilbyde deres tjenester til kommuner, amter eller andre enheder med deres egne kloaksystemer.
  3. Spildevandslaboratorium COVID Test: Denne model vokser langsomt og kan vise sig at være den mest almindelige, da det generelle koncept for spildevandsbaseret epidemiologi bliver mere accepteret og etableret som en normal del af spildevandshåndtering. Faktisk lægger de højeste niveauer i den amerikanske regering grundlaget for at gøre epidemiologi til en normal del af spildevandsforvaltningen.Centers for Disease Control and Prevention (CDC) og US Department of Health and Human Services (HHS) opretter i samarbejde med agenturer i hele den føderale regering National Wastewater Surveillance System (NWSS) som svar på COVID-19-pandemien.

Fra CDC .gov :

CDC er i øjeblikket ved at udvikle en portal til statslige, stamme-, lokale og territoriale sundhedsafdelinger til at indsende spildevandstestningsdata i en national database til brug i opsummering og fortolkning af data til folkesundhedshandling. Deltagelse i en national database vil sikre data sammenlignelighed på tværs af jurisdiktioner. Data fra spildevandstestning er ikke beregnet til at erstatte eksisterende COVID-19-overvågningssystemer, men er beregnet til at supplere dem ved at levere:

– En effektiv samlet samleprøve.

– Data for samfund, hvor rettidig klinisk COVID-19-test er underudnyttet eller utilgængelig.

– Data på sub-county-niveau.

Klik her for at anmode om din demo

Datastyring

Bemærk, hvor vægten er: data. I slutningen af ​​dagen er det alt, hvad ethvert laboratorium handler om. Alt andet er i virkeligheden simpelthen et middel til slutningen af ​​rapporteringsresultater. Og når det drejer sig om en pandemisk nødsituation – eller overvågning og forebyggelse heraf – er det endnu mere vigtigt, at dataene er nøjagtige, komplette og rettidige. Og der kan ikke benægtes det, den eneste måde at være sikker på er via automatisering, specifikt en LIMS (eller LIS, på medicinsk sprog). Fjernelse af papir og manuel dataindtastning eliminerer transkriptionsfejl, fejllæsning af håndskrift, udeladelser og fejlbehæftede beregninger. Og det hjælper med at sikre rettidig rapportering, der opfylder formaterne og andre krav fra folkesundheden og føderale myndigheder.

COVIDLiMS for Environmental & Spildevandslaboratorier

Spildevandsbaseret epidemiologi, der blev indført i 2005, begynder først nu at vokse til klinisk betydning. Indtil for nylig var dens anvendelse stort set begrænset til måling af ulovligt stofforbrug . Derfor er LIMS / LIS designet specielt til COVID-19-test knappe. Genindstillingssystemer til denne unikke funktionalitet kan være vanskelige – eller i det mindste tidskrævende – og dyre. En undtagelse er COVIDLiMS for miljø- og spildevandslaboratorier fra LabLynx, Inc. Miljø- og spildevandslaboratorier har længe brugt LabLynxs grundlæggende skybaserede LIMS, ELab. Den nylige introduktion af COVIDLiMS til SARS-CoV- 2-test inkorporerer al den nødvendige funktionalitet til både traditionel spildevandstestning og SARS-CoV-2-test af spildevand.

Deltag i kampen

Muligheden er der. Og ud over de økonomiske fordele har laboratorier chancen for at yde et meningsfuldt bidrag til kampen mod COVID – faktisk en lignende sundhedstrussel – både nu og på lang sigt, som en etableret del af de offentlige sundhedssystemer. Hvorfor ikke blive involveret i denne modige nye industri?

Som en førende inden for laboratorieinformatik kan LabLynx hjælpe dig gennem LIMS til implementering af COVID-test. Vi kan skræddersy vores COVIDLiMS-løsning til dit laboratoriums unikke behov på så lidt som en uge. For mere information, kontakt på [email protected] eller ring til 866-LABLYNX (522–5969) .

Klik her for at anmode om din demo

Referencer

Forskning i COVID-19 i miljøet | US EPA

Modellering af SARS-CoV-2-aerosoler og evaluering af inaktiveringsteknikker Detektion og overvågning af SARS-CoV-2 i spildevand …

www.epa.gov

Coronavirus sygdom 2019 (COVID-19)

Brug denne vejledning til at implementere spildevandsbaseret sygdomsovervågning. Spildevandsbaseret sygdomsovervågning er en …

www.cdc.gov

National Wastewater Surveillance System

Centers for Disease Control and Prevention (CDC) og US Department of Health and Human Services (HHS), i…

www.cdc.gov

Byen Burlington, Vermont udnytter det innovative spildevandsbaserede epidemiologiske program til at stoppe…

NEW YORK- – (BUSINESS WIRE) – Den fremtidsorienterede by Burlington, Vermont har valgt GoAigua “s Spildevandsbaseret …

www.wateronline.com

Orange County Sanitation District

COVID-19 ændrede ting drastisk på kort tid. Fordi det var så uventet, førte det også med sig…

www.ocsd.com

Nye partnerskabsspor COVID-19-infektioner i Cambridge ved analyse af spildevand

Et nyt partnerskab med Biobot Analytics, Inc. i Cambridge tilbyder en ny tilgang til sporing af COVID-19-udbrud …

www.cambridgema.gov

Spildevandsbaseret epidemiologi

Spildevandsbaseret epidemiologi (WBE) (eller spildevandsbaseret overvågning eller spildevandskemisk informationsudvinding) er en…

da. wikipedia.or g

COVIDLiMS for Environmental & Spildevandslaboratorier – COVIDLiMS.com

Det komplette fleksible system til at styre alle dine behov for datastyring. Skærmpersonale, procesfækal, luft, vand eller …

www.covidlims.com

Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret. Krævede felter er markeret med *