Jak laboratoře odpadních vod mohou pomoci porazit pandemii

Když se díváme na dlouhodobé řízení SARS-CoV- 2 (virus, který způsobuje COVID-19), a dokonce i očekávaný výskyt dalších nových virů, získává úloha testování odpadních vod nový význam. Ve skutečnosti se může ukázat, že bude hrát v naší celkové strategii ještě větší roli než klinická diagnostika.

Orgány všude začaly uznávat její důležitost a programy již začaly vznikat v krajích a obcích v USA a další země. Podle Agentury pro ochranu životního prostředí (EPA):

„Předběžný výzkum z celé země a z celého světa naznačuje, že monitorování odpadních vod na přítomnost genetického markeru SARS-CoV- 2, jeho RNA, může být užitečný jako citlivý časný indikátor nízké úrovně infekcí v komunitě. Mít systém včasného varování, který by upozornil úředníky veřejného zdraví na infekci nebo nedostatek infekce, by mohlo pomoci nasměrovat zdroje, jako je individuální testování, na komunity, které to nejvíce potřebují. “

Jak se mohou laboratoře zapojit

EPA právě probíhá výzkum s cílem vyvinout optimální programy a metody pro testování SARS-CoV-2 v odpadních vodách a zveřejnila pokyny na jeho webu pro laboratoře, které se chtějí zapojit.

Centra pro kontrolu nemocí (CDC) uznala důležitou roli testování odpadních vod a zveřejnila pokyny vlastní.

Sloučení dvou odborných oblastí

Laboratoře čistíren odpadních vod a laboratoře monitorující životní prostředí mají úplné pochopení toho, co je podílející se na testování odpadních vod: metody odběru vzorků, nádoby, hloubka, průtok, ředění, filtrace, kontrolní vzorky a podobně. Laboratoře, které jsou obeznámeny s testováním COVID, na druhou stranu pravděpodobně nemají o takových věcech vůbec tušení. Podobně tyto klinické diagnostické laboratoře rozumějí molekulárním testům včetně manipulace se vzorky a přípravy, extrakce RNA, analýzy rtPCR, požadavků HIPAA a CLIA atd.

kliknutím sem požádáte o ukázku

Řekněte klinické laboratoři, aby shromáždila odpadní vodu a otestovala SARS-CoV-2, které by byly beznadějně nevybavené. Ale opak není tak pravdivý. Laboratoře pro testování odpadních vod znají všechny podrobnosti, které ovlivňují, jak sbírat a připravovat vzorky odpadů pro provedení smysluplné analýzy. Potřebují pouze přidat vybavení a protokoly PCR. A nejsou omezeni předpisy pro testování lidských pacientů HSS, které upravují klinické laboratoře. Doposud neexistují žádné důkazy o tom, že by materiály SARS-CoV-2 nalezené v odpadu představovaly jakékoli riziko infekce.

Jak v praxi vypadá testování odpadních vod COVID?

Výsledek je to, že vidíme tři hlavní způsoby, jak probíhá testování COVID odpadních vod:

  1. Spolupráce: Jedním z nejpřirozenějších přístupů je laboratoř CLIA s možnostmi testování PCR partnerem se zařízením na čištění odpadních vod. Toto partnerství se může lišit v rozdělení odpovědnosti. V nejběžnější struktuře zařízení WW zpracovává odběr a přípravu vzorků, zatímco klinická laboratoř zpracovává přípravu RNA, extrakci a testování. Hlášení je v současné době pověřeno zasíláním na útvary veřejného zdraví, které se mohou postarat o předávání údajů do CDC. Jinak musí být klinické výsledky zaslány také CDC. Systémy se bohužel liší stát od státu – ale většina států pracuje na konsolidaci a zjednodušení vykazování zátěží pro laboratoře. V jiném široce používaném přístupu zařízení WW zasílají vzorky výzkumným programům , z nichž mnohé jsou financovány vládou prostřednictvím univerzit.
  2. Poradenství: Laboratoře, které najdou sami v pozici, kdy tak mohou činit, nabízejí své služby obcím, krajům nebo jiným subjektům s vlastními kanalizačními systémy.
  3. Wastewater Lab COVID Testing: Tento model roste pomalu a může se ukázat jako nejběžnější, protože obecný koncept epidemiologie založené na odpadních vodách se stává běžnější součástí nakládání s odpadními vodami. Nejvyšší úrovně ve vládě USA skutečně staví základy k tomu, aby se epidemiologie stala běžnou součástí nakládání s odpadními vodami.Centra pro kontrolu a prevenci nemocí (CDC) a americké ministerstvo zdravotnictví a sociálních služeb (HHS) ve spolupráci s agenturami v celé federální vládě vytvářejí národní dohled nad odpadními vodami. Systém (NWSS) v reakci na pandemii COVID-19.

Z CDC .gov :

CDC v současné době vyvíjí portál pro státní, kmenové, místní a územní zdravotnické útvary pro předkládání údajů o testování odpadních vod do národní databáze pro použití při shrnutí a interpretace údajů pro opatření v oblasti veřejného zdraví. Účast v národní databázi zajistí srovnatelnost údajů napříč jurisdikcemi. Údaje ze zkoušek odpadních vod nemají nahradit stávající systémy dozoru COVID-19, ale mají je doplnit poskytnutím:

– Účinný společný vzorek komunity.

– Data pro komunity, kde je včasné klinické testování COVID-19 nedostatečně využíváno nebo není k dispozici.

– Data na nižší než krajské úrovni.

kliknutím sem požádáte o ukázku

Správa dat

Všimněte si, kde je kladen důraz: data. Na konci dne je to vše, o čem je každá laboratoř. Všechno ostatní je ve skutečnosti jednoduše prostředkem ke konci vykazování výsledků. A pokud jde o pandemickou mimořádnou událost – nebo o její monitorování a prevenci – je ještě důležitější, aby údaje byly přesné, úplné a včasné. A nelze to popřít, jediný způsob, jak si to být jistý, je automatizace, konkrétně LIMS (nebo LIS, v lékařské řeči). Odstranění papírového a ručního zadávání dat eliminuje chyby přepisu, nesprávné čtení rukopisu, opomenutí a chybné výpočty. A pomáhá zajistit včasné podávání zpráv, které splňuje formáty a další požadavky orgánů veřejného zdraví a federálních úřadů.

COVIDLiMS for Environmental & Wastewater Labs

Epidemiologie založená na odpadních vodách, zavedená v roce 2005, teprve nyní začíná růst klinicky. Až donedávna bylo jeho užívání z velké části omezeno na měření spotřeby nelegálních drog . V důsledku toho jsou LIMS / LIS navržené speciálně pro testování COVID-19 vzácné. Opětovné navržení systémů pro tuto jedinečnou funkci může být obtížné – nebo alespoň časově náročné – a drahé. Jedinou výjimkou je COVIDLiMS pro laboratoře pro životní prostředí a odpadní vody z LabLynx, Inc. Laboratoře pro životní prostředí a čištění odpadních vod již dlouho používají základní cloudový LIMS společnosti LabLynx, ELab. Nedávné zavedení COVIDLiMS pro SARS-CoV- 2 testování zahrnuje všechny funkce potřebné jak pro tradiční testování odpadních vod, tak pro testování odpadních vod SARS-CoV-2.

Připojte se k boji

Příležitost je tu. Kromě finančních odměn mají laboratoře šanci významně přispět k boji proti COVID – vlastně jakékoli podobné zdravotní hrozbě – jak nyní, tak dlouhodobě, jako zavedená součást systémů veřejného zdraví. Proč se nezapojit do tohoto odvážného nového odvětví?

Jako lídr v oboru laboratorní informatiky vám LabLynx může pomoci prostřednictvím procesu nasazení testování LIMS for COVID. Můžeme přizpůsobit naše řešení COVIDLiMS jedinečným potřebám vaší laboratoře už za týden. Další informace získáte na [email protected] nebo volejte 866-LABLYNX (522–5969) .

kliknutím sem požádáte o ukázku

Reference

Výzkum COVID-19 v životním prostředí | US EPA

Modelování aerosolů SARS-CoV-2 a hodnocení technik deaktivace Detekce a monitorování SARS-CoV-2 v odpadních vodách …

www.epa.gov

Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)

Tyto pokyny použijte k provádění dozoru nad chorobami z odpadních vod. Dohled nad chorobami z odpadních vod je…

www.cdc.gov

národní systém dozoru nad odpadními vodami

Centra pro kontrolu a prevenci nemocí (CDC) a americké ministerstvo zdravotnictví a sociálních služeb (HHS) na…

www.cdc.gov

Město Burlington, Vermont využívá inovativní program epidemiologie odpadních vod k zastavení…

NEW YORK- – (BUSINESS WIRE) – Výhledové město Burlington ve Vermontu si vybralo GoAigua na bázi odpadních vod…

www.wateronline.com

Orange County Sanitation District

COVID-19 změnil věci drasticky za krátkou dobu. Protože to bylo tak neočekávané, přineslo to také…

www.ocsd.com

Nové partnerství sleduje infekce COVID-19 v Cambridge analýzou odpadních vod

Nové partnerství se společností Biobot Analytics, Inc. v Cambridge nabízí nový přístup ke sledování ohnisek nákazy COVID-19…

www.cambridgema.gov

Epidemiologie odpadních vod

Epidemiologie odpadních vod (WBE) (nebo dozor nad odpadními vodami nebo těžba chemických informací z odpadních vod) je…

en. wikipedia.or g

COVIDLiMS pro životní prostředí & Wastewater Labs – COVIDLiMS.com

Kompletní flexibilní systém pro správu všech vašich potřeb správy dat. Zaměstnanci obrazovky, zpracovávají fekálie, vzduch, vodu nebo…

www.covidlims.com

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna. Vyžadované informace jsou označeny *